Intercambio de Experiencias en Microscopía (IdEM) 2026

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Vuelve nuestro espacio virtual Intercambio de Experiencias en Microscopía – IdEM, organizado por el Grupo de Trabajo de Training & Education. Este Ciclo 2026 se denomina: “Microscopía en Práctica – Experiencias Detrás de Escena en Bioimaging

  • Modalidad: Virtual (con registro)
  • Horario: 12:00 h (GMT-3)
  • Duración: 60 minutos

Nuevo Formato Interactivo 2026

Este año, IdEM será aún más interactivo. Invitados, preguntas en vivo y participación de la audiencia a través del chat, micrófono y Mentimeter, generando un intercambio en tiempo real entre los invitados y la comunidad.

Cada sesión contará con:
  • 3 Invitados compartiendo experiencias y preguntas
  • Participación activa vía chat, micrófono y Mentimeter
  • Intercambio en tiempo real entre oradores y audiencia
  • Preguntas clave que buscaremos responder juntos
Estructura de cada sesión:
  1. Bienvenida y conexión a Mentimeter 
  2. Presentación de oradores y moderador
  3. Ciclo de preguntas interactivas entre moderador, oradores y participantes
  4. Cierre y próximos encuentros 

Las charlas serán en español y portugués


Inscripciones aquí

 

Sesión 1. Conociéndonos: sabiduría oculta en los Core Facility de Microscopía.
  • Jueves 4 de Junio – 12:00 (GMT-3)

Descripción: Detrás de cada imagen de portada hay un técnico experto y un desafío logístico que pocos ven. Iniciamos el ciclo 2026 invitando a conocer los secretos dentro de una Core Facility,  que te permitirán optimizar tu tiempo frente al microscopio. Únete a la charla junto a los responsables del día a día en distintos centros de Latinoamérica para responder lo que todo microscopista necesita saber.

 

Preguntas clave:

  • El «Manual No Escrito»: ¿Cuál es el error #1 que arruina tus imágenes? 
  • ¿Qué artefactos son comunes en microscopía de Fluorescencia y Electrónica? 
  • ¿Autonomía o asistencia? Cuánto tardas en ser un experto.
  • Datos, no solo fotos: Cómo transformar píxeles en ciencia cuantitativa.

Invitados:

  • Nicole Salgado (Santiago, Chile),
  • Carlos Mas (CEMINCO, CONICET – Universidad Nacional de Córdoba, Argentina),
  • Juan Orozco  (MicroCore, Universidad de los Andes, Colombia)

Moderan:

  • Iván Rey
  • Victoria Repetto

 


Sesión 2. Microscopía Volumétrica: Del 2D al 3D en la Práctica
  • Miércoles 2 de Julio – 12:00 (GMT-3)

Descripción: La microscopía volumétrica ha revolucionado nuestra capacidad de entender estructuras tridimensionales, pero implementarla en la práctica diaria presenta desafíos únicos. En esta sesión exploraremos diferentes aproximaciones para imaging 3D: desde microscopía confocal y lightsheet hasta técnicas de microscopía electrónica volumétrica. Compartiremos experiencias sobre preparación de muestras, optimización de protocolos de adquisición, y estrategias para manejar y analizar grandes volúmenes de datos. Discutiremos qué técnica elegir según el sistema biológico, los recursos disponibles, y las preguntas científicas que queremos responder.

 

Preguntas clave:

  • ¿Qué técnica volumétrica usas más frecuentemente y por qué?
  • ¿Cuál es tu principal desafío en la preparación de muestras para imaging 3D?
  • ¿Cómo manejas el almacenamiento y procesamiento de datasets volumétricos grandes?
  • ¿Qué software/pipeline usas para análisis de imágenes 3D?
  • ¿Cuánto tiempo típicamente dedicas a optimizar un protocolo de adquisición 3D?
  • ¿Qué consejo darías a alguien que está comenzando con microscopía volumétrica?

Invitados:

  • TBD – especialistas en confocal/lightsheet/FIB-SEM

Modera:

  • Aníbal Vargas (LiSIUM, UM, Santiago de Chile)

 


Sesión 3. Microscopía en Neuronas: Visualizando el Sistema Nervioso
  • Miércoles 30 de Julio – 12:00 (GMT-3)

Descripción: El tejido nervioso presenta desafíos únicos para microscopía debido a su complejidad estructural, delicadeza, y las escalas espaciales que debemos abarcar—desde sinapsis nanométricas hasta redes neuronales milimétricas. En esta sesión compartiremos experiencias prácticas trabajando con neuronas: desde cultivos celulares hasta tejido cerebral intacto. Discutiremos estrategias de marcación, técnicas de clearing para tejido denso, aproximaciones para imaging de células vivas vs. fijas, y cómo capturar tanto morfología fina como actividad funcional. Exploraremos qué nos ha funcionado (¡y qué no!) al intentar visualizar la extraordinaria complejidad del sistema nervioso.

 

Preguntas clave:

  • ¿Qué sistema trabajas más: cultivos neuronales, slices, o tejido intacto?
  • ¿Cuál es tu mayor desafío técnico al hacer imaging de neuronas?
  • ¿Qué método de marcación/contraste prefieres para tu sistema y por qué?
  • ¿Has usado técnicas de tissue clearing? ¿Cuál y con qué resultados?
  • ¿Cómo balanceas resolución espacial vs. temporal en imaging funcional?
  • ¿Qué te hubiera gustado saber antes de comenzar a hacer microscopía en neuronas?


Invitados:

  • TBD – neurocientíficos con diferentes aproximaciones

Modera:

  • Luciana Gallo

 


Sesión 4. Intravital Imaging: Viendo la Vida en Acción
  • Miércoles 27 de Agosto – 12:00 (GMT-3)

Descripción: El intravital imaging nos permite observar procesos biológicos en organismos vivos, pero requiere superar desafíos técnicos y biológicos únicos. En esta sesión compartiremos experiencias prácticas sobre diferentes aproximaciones de microscopía intravital: desde imaging de embriones transparentes hasta ventanas quirúrgicas en modelos mamíferos. Discutiremos preparación de animales, estabilización de muestras durante adquisición, manejo de movimiento y señales fisiológicas, estrategias de marcación que minimizan perturbación, y consideraciones éticas. Exploraremos cómo obtener datos informativos mientras mantenemos al organismo en condiciones fisiológicas lo más naturales posible.

 

Preguntas clave:

  • ¿Qué modelo/organismo usas para intravital imaging y por qué lo elegiste?
  • ¿Cuál es tu estrategia principal para estabilizar la muestra durante la adquisición?
  • ¿Cómo manejas el movimiento debido a la respiración/circulación?
  • ¿Qué tipo de marcadores fluorescentes te han dado mejores resultados in-vivo?
  • ¿Cuál ha sido tu mayor desafío técnico o ético en intravital imaging?
  • ¿Qué duración máxima has logrado en sesiones de imaging sin comprometer al animal?


Invitados:

  • TBD – especialistas en intravital]


Modera:

  • Vanessa De Cassia Martins

 


Sesión 5. Análisis de Imágenes en el Día a Día: De Píxeles a Papers

Miércoles 24 de Septiembre – 12:00 (GMT-3)

Descripción: Adquirir imágenes hermosas es solo el comienzo—transformarlas en datos cuantitativos robustos es donde sucede la ciencia. En esta sesión compartiremos workflows prácticos de análisis que usamos cotidianamente: desde pre-procesamiento básico hasta segmentación automatizada y cuantificación. Discutiremos qué herramientas elegir según el tipo de análisis (Fiji/ImageJ, CellProfiler, ilastik, QuPath, Python, o herramientas comerciales), cómo validar nuestros métodos de análisis, estrategias para batch processing, y buenas prácticas para documentar pipelines reproducibles. Compartiremos también nuestros errores más comunes y cómo los detectamos/corregimos.

 

Preguntas clave:

  • ¿Qué herramienta(s) de análisis usas más frecuentemente?
  • ¿Cuál es tu mayor desafío en el análisis de imágenes?
  • ¿Cómo decides si un análisis manual vs. automatizado es más apropiado?
  • ¿Qué estrategia usas para validar que tu pipeline de análisis funciona correctamente?
  • ¿Cómo documenta tu análisis para asegurar reproducibilidad?
  • ¿Has encontrado algún «truco» o buena práctica que mejoró significativamente tu análisis?


Invitados:

  • TBD – especialistas en diferentes herramientas/aproximaciones

 

Modera:

  • Lorena Sigaut

 


Sesión 6. Conociéndonos: Core Facilities de América Latina en movimiento

Miércoles 22 de Octubre – 12:00 (GMT-3)

Descripción: Cerramos el ciclo 2026 explorando de cerca cómo funcionan diferentes core facilities en América Latina, esta vez enfocándonos en cómo innovan y se sostienen en el tiempo. Tres facilities compartirán sus estrategias para mantenerse actualizadas tecnológicamente con presupuestos limitados, cómo generan valor para sus instituciones, sus modelos de financiamiento (internos, externos, mixtos), y cómo miden y comunican su impacto. Discutiremos también cómo estas facilities están incorporando nuevas tendencias (AI, data management, multimodal imaging) y preparándose para el futuro. Una oportunidad para aprender no solo qué hacen las facilities, sino cómo se aseguran de poder seguir haciéndolo.

 

Preguntas clave:

  • ¿Cuál es tu modelo de financiamiento y qué tan sostenible lo consideras?
  • ¿Cómo justificas inversiones en nuevos equipos/tecnologías ante tu institución?
  • ¿Qué métricas usas para demostrar el impacto/valor de tu facility?
  • ¿Cómo te mantienes actualizado con nuevas tecnologías sin grandes presupuestos?
  • ¿Qué innovación reciente implementaste y cómo resultó?
  • ¿Cuál es tu visión para tu facility en los próximos 3-5 años?


Invitados:

  • TBD – 3 facilities diferentes a las de mayo, idealmente de países distintos

Moderan:

  • Iván Rey / Victoria Repetto

 

¿Querés ser parte de IdEM?

¿Tenés una experiencia para compartir? ¡Este espacio es colaborativo y se construye con toda la comunidad LABI!

  • Proponer un tema para futuros ciclos
  • Participar como orador/a compartiendo tu expertise
  • Sugerir preguntas para las sesiones interactivas
  • Moderar una sesión

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